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Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift

Comparing the presence of different genes in Salmonella subspecies I–IV and development of a diagnostic multiplex PCR method for identification of Salmonella subspecies

Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift 126, 16-24

DOI: 10.2376/0005-9366-126-16

Publiziert: 01/2013

Summary

Reptile-associated salmonellosis in humans has become a growing problem world- wide. Reptiles are frequently asymptomatic carriers of Salmonella and therefore, they are considered as an important reservoir for these bacteria.The classical biochemical method for Salmonella subspecies detection is time consum- ing, especially in samples from reptiles since they frequently carry more than one Salmonella subspecies. The aim of this study was therefore to develop a multiplex PCR assay for a rapid and accurate differentiation of Salmonella subspecies I, II, IIIa, IIIb and IV. In the present study, the occurrence of the genes invA, ttrCA, iroB, STM4075, sciA, STM3690, sadA, gatD, foxA, pagN, fljB, iucD, spvB, lacZ, iutA, mdcA and irp2 was examined in 41 Salmonella strains from Middle Eastern animals (mainly reptiles) by monoplex PCR. According to the results a multiplex PCR assay was developed based on the genes ttrCA, sciA, foxA, iutA. Compared to biochemical analysis this method alloweda fast identification of the subspecies from all the Middle Eastern Salmonella strains(n = 41), as well as 79 strains from German children (n = 18) with reptile associated salmonellosis and other humans and animals (n = 61) with salmonellosis. These results revealed the multiplex PCR as a fast assay for a specific identification of Salmonella subspecies I, II, IIIa, and IIIb.
Salmonella
salmonellosis
subspecies
reptiles
PCR

Zusammenfassung

Reptilien-assoziierte Salmonellose bei Kleinkindern ist weltweit ein Problem. Reptilien sind häufig asymptomatische Salmonellenträger und stellen deswegen ein wichtiges Salmonellenreservoir dar.Die klassische biochemische Subspeziesdifferenzierung ist sehr zeitaufwendig, beson- ders in diagnostischen Proben von Reptilien, da diese häufig Träger von mehr als einer Subspezies sind. Deswegen war das Ziel dieser Studie die Entwicklung eines Multiplex- PCR-Protokolls zur schnellen und exakten Differenzierung der Salmonella-Subspezies I, II, IIIa, IIIb und IV.Im Rahmen dieser Studie wurde zuerst das Vorkommen der Gene invA, ttrCA, iroB, STM4075, sciA, STM 3690, sadA, gatD, foxA, pagN, fljB, iucD, spvB, lacZ, iutA, mdcA und irp2 in 41 Salmonellenstämmen von Tieren aus dem Mittleren Osten (hauptsächlich Reptilien) untersucht. Mithilfe dieser Ergebnisse wurde eine Multiplex-PCR, basierend auf den Zielgenen ttrCA, sciA, foxA und iutA, entwickelt. Im Vergleich mit der biochemischen Analyse ermoglichte es diese Methode, die Subspezies von allen Stämmen aus dem Mittleren Osten (n = 41) sowie von 79 Stämmen von deutschen Kindern(n = 18) mit Reptilien-assoziierter Salmonellose und anderen Stämmen von Menschen und Tieren (n = 61) schnell zu bestimmen.Diese Ergebnisse belegen den Nutzen der Multiplex-PCR zur Differenzierung der Salmonella-Subspezies I, II, IIIa und IIIb.
Salmonella
salmonellosis
Subspezies
Reptilien
PCR

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