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Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift

Molecular detection and analysis of Sheeppox and Orf viruses isolated from sheep from Qalubia, Egypt

Molekularer Nachweis und Analyse von Schafpocken- und Orf-Viren in Schafproben aus Qalubia, Ägypten

Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift 129, 310-317

DOI: 10.2376/0005-9366-15076

Publiziert: 07/2016

Summary

In this study an outbreak with Sheeppox virus (SPPV) and Orf virus (ORFV) in one sheep herd in the Qalubia province, Egypt, was investigated. Both, SPPV and ORFV caused clinically manifest infections among sheep. The affected sheep showed skin lesions around the mouth or all over the body. Therefore, reliable diagnosis should confirm the aetiology of the infection and then reduce spread of the diseases in the affected areas. Clinical samples were investigated by virus isolation, PCR and real-time PCR assays. Furthermore, PCR-products of SPPV and ORFV isolates were sequenced and alignment to reference isolates was performed for phylogenetic analyses. The laboratory diagnosis showed that real-time PCR assay was more accurate and sensitive than conventional PCR and virus isolation. In phylogenetic analysis of the A29L gene genetic differences between SPPV field strains were not observed and the strains showed 100% homology with two SPPV isolates from Kazakhstan and one isolate from Turkey. The ORFV field strains are in the P55 gene genetically distinct from another and from other published isolates from Egypt 2006 and 2009.

Sheeppox virus
Orf virus
PCR
phylogenetic analysis

Zusammenfassung

In dieser Studie wurde ein Ausbruch von Schafpocken- und Orf-Virus in einer Schafherde in der Provinz Qalubia in Ägypten untersucht. Sowohl das Schafpocken- als auch das Orf-Virus verursachten klinisch manifeste Infektionen bei den Schafen. Betroffene Schafe zeigten Hautläsionen rings um das Maul und verteilt über den gesamten Körper. Eine verlässliche Diagnose ist unerlässlich, um die Infektionsursache eindeutig zu identifizieren und um die Ausbreitung dieser Krankheiten in betroffenen Gebieten einzudämmen. Klinische Proben wurden mittels Virusisolierung, PCR und real-time PCR untersucht. Des Weiteren wurden PCR-Produkte von Schafpocken- und Orf-Virusisolaten sequenziert und mit bereits bekannten Sequenzen aus der GenBank verglichen, um die Viren weiter zu untersuchen. In Bezug auf die Labordiagnose wurde deutlich, dass die real-time PCR präzisere und sensitivere Ergebnisse lieferte als die konventionelle PCR und die Virusisolierung. Phylogenetische Analysen des A29L-Gens machten deutlich, dass die isolierten Feldstämme der Schafpocken genetisch untereinander keine Unterschiede und 100 % Homologie zu zwei Isolaten aus Kasachstan und einem Isolat aus der Türkei zeigten. Die ORFV-Feldisolate zeigten im P55-Gen genetische Unterschiede sowohl untereinander als auch zu anderen Isolaten, die 2006 und 2009 in Ägypten gefunden wurden.

Schafpockenvirus
Orf-Virus
PCR
Phylogenetische Analyse

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