%0 Journal Article %K Paratuberculosis %K Johne’s disease %K genotyping %K MAP transmission %B Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift %C Hannover %D 2017 %G English %I Schlütersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG %R 10.2376/0005-9366-17032 %T First comprehensive study on molecular diversity of Austrian Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis isolates from domestic and wild ruminants %V 130 %1 {"oldId":104965,"title":"First comprehensive study on molecular diversity of Austrian Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis isolates from domestic and wild ruminants","topline":"","teaserText":"Erste umfangreiche Studie zur molekularen Diversit\u00e4t von Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis Isolaten von Haus- und Wildwiederk\u00e4uern aus \u00d6sterreich","content":"

Summary<\/span>
The aim of this study was to gain knowledge of Mycobacterium avium <\/span>subspecies paratuberculosis<\/span> (MAP) diversity, distribution and possible transmission in Austria. 249 isolates derived from 221 cattle (107 herds), 19 goats (one herd), one sheep and seven wild ruminants (red deer, roe deer, moufflon) were investigated. The isolates were subjected to Insertion Sequence 900<\/span> (IS900<\/span>) based Restriction Fragment Length Polymorphism analysis (IS900<\/span>-RFLP) and Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number Tandem-Repeat typing (MIRU-VNTR). Isolates originated from samples tested within the framework of the Austrian paratuberculosis control program and clinical diagnostics.
Using IS900<\/span>-RFLP and restriction enzyme BstE<\/span>II seven types were found: C1, C14, C18, C28 and three new ones. All isolates belonged to the C-type. Using Pst<\/span>I restriction six profiles were obtained, of which only P1 was already published before. Eight INRA Nouzilly MIRU-VNTR (INMV) profiles were detected by MIRU-VNTR (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80). The combination of IS900<\/span>-RFLP and MIRU-VNTR allowed the discrimination between 20 combined MAP genotypes named AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) was the most frequently found one, namely in 39% of the isolates. In nine out of 35 cattle herds with two or more isolates more than one combined MAP genotype was found. Examination of the seven wild ruminant isolates exhibited four combined genotypes also detected in local cattle and sheep herds suggesting MAP transmission among these species. The characterization of MAP using IS900<\/span>-RFLP and MIRU-VNTR gives valuable information about diversity and distribution of MAP in Austria and of possible transmission routes.<\/p>

Zusammenfassung<\/span>
Ziel dieser Studie war, Erkenntnisse \u00fcber die Diversit\u00e4t, die Verteilung und \u00fcber m\u00f6gliche \u00dcbertragungswege von Mycobacterium avium <\/span>subspecies paratuberculosis<\/span> (MAP) in \u00d6sterreich zu erlangen. Es wurden insgesamt 249 Isolate von 221 Rindern aus 107 Herden, 19 Ziegen aus einer Herde, einem Schaf und sieben Wildwiederk\u00e4uern (Rotwild, Rehwild, Mufflon) untersucht. Die MAP-Isolate wurden mittels IS900<\/span>-basierter Restriktions-Fragment-L\u00e4ngen Polymorphismus-Analyse (IS900<\/span>-RFLP) und \u201eMycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number of Tandem-Repeat\u201c Typisierung (MIRU-VNTR) differenziert. Die Isolate stammten aus dem \u00f6sterreichischen Paratuberkulose-\u00dcberwachungsprogramm und der Routinediagnostik.
Unter Verwendung von IS900<\/span>-RFLP mit dem Restriktionsenzym BstE<\/span>II wurden sieben Typen gefunden: C1, C14, C18, C28 sowie drei bisher nicht ver\u00f6ffentlichte RFLP-Muster. Alle Isolate geh\u00f6rten zum C-Typ. Die IS900<\/span>-RFLP mit dem Restriktionsenzym Pst<\/span>I zeigte sechs Profile, von denen f\u00fcnf Profile neu waren. Mittels MIRU-VNTR wurden acht INMV-Profile (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80) nachgewiesen. Die Kombination von IS900<\/span>-RFLP und MIRU-VNTR erm\u00f6glichte die Unterscheidung von 20 kombinierten MAP-Genotypen bezeichnet als AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) trat am h\u00e4ufigsten auf (39% der Isolate). In neun von 35 Rinderherden von denen zwei oder mehrere Isolate untersucht wurden, wurde mehr als ein kombinierter MAP-Genotyp gefunden. Die Untersuchung der sieben Wildwiederk\u00e4uer-Isolate ergab vier kombinierte Genotypen, welche auch bei Rindern und einem Schaf detektiert wurden. Dies l\u00e4sst auf eine MAP-\u00dcbertragung zwischen Haus- und Wildwiederk\u00e4uern schlie\u00dfen. Die Charakterisierung von MAP mit IS900<\/span>-RFLP und MIRU-VNTR lieferte wertvolle Informationen zur Diversit\u00e4t und Verteilung von MAP in \u00d6sterreich und zu m\u00f6glichen \u00dcbertragungswegen.<\/p>","categories":["Open Access","Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel","Abostufe frei"],"fromDate":"Oct 18, 2017 8:09:16 AM","oldUrls":["http:\/\/vetline.de\/first-comprehensive-study-on-molecular-diversity-of-austrian-mycobacterium-avium-subspecies-paratuberculosis-isolates-from-domestic-and-wild-ruminants\/150\/3216\/104965","http:\/\/vetline.de\/first-comprehensive-study-on-molecular-diversity-of-austrian-mycobacterium-avium-subspecies-paratuberculosis-isolates-from-domestic-and-wild-ruminants\/150\/3130\/104965"],"doiLanguage":"englisch","doiProductFormat":"online","doiPublisher":"Schl\u00fctersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG","doiSerialWorkTitle":"Berl M\u00fcnch Tier\u00e4rztl Wochensch","doiDocumentUri":"https:\/\/vetline.de\/files\/smfiledata\/6\/8\/5\/6\/1\/0\/BMW_OA_17032_Sodoma_onl300_final.pdf","doiSource":"Berl M\u00fcnch Tier\u00e4rztl Wochensch","doiissn":"0005-9366","doiNr":"10.2376\/0005-9366-17032","doiFirstPage":".","doiLastPage":"..","doiTransmitted":true,"doiAuthor":"Sodoma E, Altmann M, Mitterhuemer S, Moebius P, Duenser M","pdf":{"path":"http:\/\/data\/BMW_OA_17032_Sodoma_onl300_final.pdf","title":"BMTW OA 17032 Sodoma","description":"First comprehensive study on molecular diversity of Austrian Mycobacterium avium\r\nsubspecies paratuberculosis isolates from domestic and wild ruminants"},"authors":[{"firstName":"E","middleName":"","lastName":"Sodoma"},{"firstName":"M","middleName":"","lastName":"Altmann"},{"firstName":"S","middleName":"","lastName":"Mitterhuemer"},{"firstName":"P","middleName":"","lastName":"Moebius"},{"firstName":"M","middleName":"","lastName":"Duenser"}],"contentOptimised":"

Summary<\/strong>
The aim of this study was to gain knowledge of Mycobacterium avium <\/em>subspecies paratuberculosis<\/em> (MAP) diversity, distribution and possible transmission in Austria. 249 isolates derived from 221 cattle (107 herds), 19 goats (one herd), one sheep and seven wild ruminants (red deer, roe deer, moufflon) were investigated. The isolates were subjected to Insertion Sequence 900<\/em> (IS900<\/em>) based Restriction Fragment Length Polymorphism analysis (IS900<\/em>-RFLP) and Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number Tandem-Repeat typing (MIRU-VNTR). Isolates originated from samples tested within the framework of the Austrian paratuberculosis control program and clinical diagnostics.
Using IS900<\/em>-RFLP and restriction enzyme BstE<\/em>II seven types were found: C1, C14, C18, C28 and three new ones. All isolates belonged to the C-type. Using Pst<\/em>I restriction six profiles were obtained, of which only P1 was already published before. Eight INRA Nouzilly MIRU-VNTR (INMV) profiles were detected by MIRU-VNTR (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80). The combination of IS900<\/em>-RFLP and MIRU-VNTR allowed the discrimination between 20 combined MAP genotypes named AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) was the most frequently found one, namely in 39% of the isolates. In nine out of 35 cattle herds with two or more isolates more than one combined MAP genotype was found. Examination of the seven wild ruminant isolates exhibited four combined genotypes also detected in local cattle and sheep herds suggesting MAP transmission among these species. The characterization of MAP using IS900<\/em>-RFLP and MIRU-VNTR gives valuable information about diversity and distribution of MAP in Austria and of possible transmission routes.<\/p>

Zusammenfassung<\/strong>
Ziel dieser Studie war, Erkenntnisse \u00fcber die Diversit\u00e4t, die Verteilung und \u00fcber m\u00f6gliche \u00dcbertragungswege von Mycobacterium avium <\/em>subspecies paratuberculosis<\/em> (MAP) in \u00d6sterreich zu erlangen. Es wurden insgesamt 249 Isolate von 221 Rindern aus 107 Herden, 19 Ziegen aus einer Herde, einem Schaf und sieben Wildwiederk\u00e4uern (Rotwild, Rehwild, Mufflon) untersucht. Die MAP-Isolate wurden mittels IS900<\/em>-basierter Restriktions-Fragment-L\u00e4ngen Polymorphismus-Analyse (IS900<\/em>-RFLP) und \u201eMycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number of Tandem-Repeat\u201c Typisierung (MIRU-VNTR) differenziert. Die Isolate stammten aus dem \u00f6sterreichischen Paratuberkulose-\u00dcberwachungsprogramm und der Routinediagnostik.
Unter Verwendung von IS900<\/em>-RFLP mit dem Restriktionsenzym BstE<\/em>II wurden sieben Typen gefunden: C1, C14, C18, C28 sowie drei bisher nicht ver\u00f6ffentlichte RFLP-Muster. Alle Isolate geh\u00f6rten zum C-Typ. Die IS900<\/em>-RFLP mit dem Restriktionsenzym Pst<\/em>I zeigte sechs Profile, von denen f\u00fcnf Profile neu waren. Mittels MIRU-VNTR wurden acht INMV-Profile (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80) nachgewiesen. Die Kombination von IS900<\/em>-RFLP und MIRU-VNTR erm\u00f6glichte die Unterscheidung von 20 kombinierten MAP-Genotypen bezeichnet als AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) trat am h\u00e4ufigsten auf (39% der Isolate). In neun von 35 Rinderherden von denen zwei oder mehrere Isolate untersucht wurden, wurde mehr als ein kombinierter MAP-Genotyp gefunden. Die Untersuchung der sieben Wildwiederk\u00e4uer-Isolate ergab vier kombinierte Genotypen, welche auch bei Rindern und einem Schaf detektiert wurden. Dies l\u00e4sst auf eine MAP-\u00dcbertragung zwischen Haus- und Wildwiederk\u00e4uern schlie\u00dfen. Die Charakterisierung von MAP mit IS900<\/em>-RFLP und MIRU-VNTR lieferte wertvolle Informationen zur Diversit\u00e4t und Verteilung von MAP in \u00d6sterreich und zu m\u00f6glichen \u00dcbertragungswegen.<\/p>","primaryLanguage":"englisch","summary":"The aim of this study was to gain knowledge of Mycobacterium avium <\/em>subspecies paratuberculosis<\/em> (MAP) diversity, distribution and possible transmission in Austria. 249 isolates derived from 221 cattle (107 herds), 19 goats (one herd), one sheep and seven wild ruminants (red deer, roe deer, moufflon) were investigated. The isolates were subjected to Insertion Sequence 900<\/em> (IS900<\/em>) based Restriction Fragment Length Polymorphism analysis (IS900<\/em>-RFLP) and Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number Tandem-Repeat typing (MIRU-VNTR). Isolates originated from samples tested within the framework of the Austrian paratuberculosis control program and clinical diagnostics.
Using IS900<\/em>-RFLP and restriction enzyme BstE<\/em>II seven types were found: C1, C14, C18, C28 and three new ones. All isolates belonged to the C-type. Using Pst<\/em>I restriction six profiles were obtained, of which only P1 was already published before. Eight INRA Nouzilly MIRU-VNTR (INMV) profiles were detected by MIRU-VNTR (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80). The combination of IS900<\/em>-RFLP and MIRU-VNTR allowed the discrimination between 20 combined MAP genotypes named AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) was the most frequently found one, namely in 39% of the isolates. In nine out of 35 cattle herds with two or more isolates more than one combined MAP genotype was found. Examination of the seven wild ruminant isolates exhibited four combined genotypes also detected in local cattle and sheep herds suggesting MAP transmission among these species. The characterization of MAP using IS900<\/em>-RFLP and MIRU-VNTR gives valuable information about diversity and distribution of MAP in Austria and of possible transmission routes.<\/p>

","zusammenfassung":"Ziel dieser Studie war, Erkenntnisse \u00fcber die Diversit\u00e4t, die Verteilung und \u00fcber m\u00f6gliche \u00dcbertragungswege von Mycobacterium avium <\/em>subspecies paratuberculosis<\/em> (MAP) in \u00d6sterreich zu erlangen. Es wurden insgesamt 249 Isolate von 221 Rindern aus 107 Herden, 19 Ziegen aus einer Herde, einem Schaf und sieben Wildwiederk\u00e4uern (Rotwild, Rehwild, Mufflon) untersucht. Die MAP-Isolate wurden mittels IS900<\/em>-basierter Restriktions-Fragment-L\u00e4ngen Polymorphismus-Analyse (IS900<\/em>-RFLP) und \u201eMycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number of Tandem-Repeat\u201c Typisierung (MIRU-VNTR) differenziert. Die Isolate stammten aus dem \u00f6sterreichischen Paratuberkulose-\u00dcberwachungsprogramm und der Routinediagnostik.
Unter Verwendung von IS900<\/em>-RFLP mit dem Restriktionsenzym BstE<\/em>II wurden sieben Typen gefunden: C1, C14, C18, C28 sowie drei bisher nicht ver\u00f6ffentlichte RFLP-Muster. Alle Isolate geh\u00f6rten zum C-Typ. Die IS900<\/em>-RFLP mit dem Restriktionsenzym Pst<\/em>I zeigte sechs Profile, von denen f\u00fcnf Profile neu waren. Mittels MIRU-VNTR wurden acht INMV-Profile (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80) nachgewiesen. Die Kombination von IS900<\/em>-RFLP und MIRU-VNTR erm\u00f6glichte die Unterscheidung von 20 kombinierten MAP-Genotypen bezeichnet als AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) trat am h\u00e4ufigsten auf (39% der Isolate). In neun von 35 Rinderherden von denen zwei oder mehrere Isolate untersucht wurden, wurde mehr als ein kombinierter MAP-Genotyp gefunden. Die Untersuchung der sieben Wildwiederk\u00e4uer-Isolate ergab vier kombinierte Genotypen, welche auch bei Rindern und einem Schaf detektiert wurden. Dies l\u00e4sst auf eine MAP-\u00dcbertragung zwischen Haus- und Wildwiederk\u00e4uern schlie\u00dfen. Die Charakterisierung von MAP mit IS900<\/em>-RFLP und MIRU-VNTR lieferte wertvolle Informationen zur Diversit\u00e4t und Verteilung von MAP in \u00d6sterreich und zu m\u00f6glichen \u00dcbertragungswegen.<\/p>","translatedTitle":"Erste umfangreiche Studie zur molekularen Diversit\u00e4t von Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis Isolaten von Haus- und Wildwiederk\u00e4uern aus \u00d6sterreich","abstractE":"The aim of this study was to gain knowledge of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) diversity, distribution and possible transmission in Austria. 249 isolates derived from 221 cattle (107 herds), 19 goats (one herd), one sheep and seven wild ruminants (red deer, roe deer, moufflon) were investigated. The isolates were subjected to Insertion Sequence 900 (IS900) based Restriction Fragment Length Polymorphism analysis (IS900-RFLP) and Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number Tandem-Repeat typing (MIRU-VNTR). Isolates originated from samples tested within the framework of the Austrian paratuberculosis control program and clinical diagnostics. Using IS900-RFLP and restriction enzyme BstEII seven types were found: C1, C14, C18, C28 and three new ones. All isolates belonged to the C-type. Using PstI restriction six profiles were obtained, of which only P1 was already published before. Eight INRA Nouzilly MIRU-VNTR (INMV) profiles were detected by MIRU-VNTR (INMV 1, 2, 5, 6, 12, 13, 17, 80). The combination of IS900-RFLP and MIRU-VNTR allowed the discrimination between 20 combined MAP genotypes named AT (Austria) 1\u201320. AT 2 (C1-P1\/INMV 2) was the most frequently found one, namely in 39% of the isolates. In nine out of 35 cattle herds with two or more isolates more than one combined MAP genotype was found. Examination of the seven wild ruminant isolates exhibited four combined genotypes also detected in local cattle and sheep herds suggesting MAP transmission among these species. The characterization of MAP using IS900-RFLP and MIRU-VNTR gives valuable information about diversity and distribution of MAP in Austria and of possible transmission routes.","date":{"year":2017,"date":"10\/2017","accepted":"2017-10-18"},"volume":130,"openAccess":true,"journal":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","titleImageId":944,"pages":"","redirects":["first-comprehensive-study-on-molecular-diversity-of-austrian-mycobacterium-avium-subspecies-paratuberculosis-isolates-from-domestic-and-wild-ruminants\/150\/3216\/104965","first-comprehensive-study-on-molecular-diversity-of-austrian-mycobacterium-avium-subspecies-paratuberculosis-isolates-from-domestic-and-wild-ruminants\/150\/3130\/104965"],"tierartCategories":[],"artikelartCategories":["Open Access","Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel","Abostufe frei"]} %8 10/2017