%0 Journal Article %K zoonosis %K CAOS-barcoding %K Pterygota %K insects %B Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift %C Hannover %D 2009 %G English %I Schlütersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG %P 446-450 %R 10.2376/0005-9366-122-446 %T Character-based DNA barcoding: a superior tool for species classification %V 122 %1 {"oldId":69758,"title":"Character-based DNA barcoding: a superior tool for species classification","teaserText":"In zoonosis research only correct assigned host-agent-vector associations canlead to success. If most biological species on Earth, from agent to host and fromprocaryotes to vertebrates, are still undetected, the development of a reliable ...","content":"

Summary<\/span>
In zoonosis research only correct assigned host-agent-vector associations canlead to success. If most biological species on Earth, from agent to host and fromprocaryotes to vertebrates, are still undetected, the development of a reliable anduniversal diversity detection tool becomes a conditio sine qua non. In this context,in breathtaking speed, modern molecular-genetic techniques have becomeacknowledged tools for the classification of life forms at all taxonomic levels.While previous DNA-barcoding techniques were criticised for several reasons(Moritz and Cicero, 2004; Rubinoff et al., 2006a, b; Rubinoff, 2006; Rubinoff andHaines, 2006) a new approach, the so called CAOS-barcoding (Character AttributeOrganisation System), avoids most of the weak points. Traditional DNA-barcodingapproaches are based on distances, i. e. they use genetic distances and treeconstruction algorithms for the classification of species or lineages. The definitionof limit values is enforced and prohibits a discrete or clear assignment. Incomparison, the new character-based barcoding (CAOS-barcoding; DeSalle et al.,2005; DeSalle, 2006; Rach et al., 2008) works with discrete single characters andcharacter combinations which permits a clear, unambiguous classification.In Hannover (Germany) we are optimising this system and developing a semiautomatichigh-throughput procedure for hosts, agents and vectors being studiedwithin the Zoonosis Centre of the \u201eStiftung Tier\u00e4rztliche Hochschule Hannover\u201c.Our primary research is concentrated on insects, the most successful and speciesrichanimal group on Earth (every fourth animal is a bug). One subgroup, thewinged insects (Pterygota), represents the outstanding majority of all zoonosisrelevant animal vectors.

Keywords:<\/span>
zoonosis, CAOS-barcoding, Pterygota, insects


Zusammenfassung<\/span>
In der Zoonosenforschung gilt, \u201enur eine korrekt bestimmte Wirt-Erreger-VektorenGemeinschaft erlaubt korrekte Forschung\u201c. Wenn auf allen Ebenen, vom Vektorzum Wirt und vom Prokaryont bis Wirbeltier, die Mehrzahl der Arten, und damitder \u00f6kologisch relevanten Lebensformen, noch gar nicht beschrieben underkannt ist, wird die Entwicklung von zuverl\u00e4ssigen und universell anwendbarenDiversit\u00e4tsdetektoren zur conditio sine qua non. In diesem Kontext, wurden innahezu atemberaubenden Tempo moderne molekulargenetische Arbeitstechnikenanerkannte Hilfsmittel f\u00fcr die Bestimmung von Lebensformen auf allentaxonomischen Ebenen.

W\u00e4hrend bisherige DNA-Barcoding-Techniken aus verschiedenen Gr\u00fcnden indie Kritik gerieten (Moritz and Cicero, 2004; Rubinoff et al., 2006a, b; Rubinoff,2006; Rubinoff and Haines, 2006), umgeht eine neue Technik, das so genannteCAOS-Barcoding die Mehrzahl der bisherigen Schwachpunkte. Alle traditionellenDNA-Barcoding-Verfahren sind distanz-basiert, d. h. sie bedienen sich genetischerDistanzen und Baumbildungsverfahren zur Zuordnung und Identifikation vonArten oder Linien. Damit ist das Festlegen von \u201eGrenzwerten\u201c erzwungen, unddiskrete und eindeutige Zuordnungen sind nicht m\u00f6glich. Das neue, so genanntecharakterbasierende Barcoding-Verfahren (CAOS-Barcoding; DeSalle et al., 2005;DeSalle, 2006; Rach et al., 2008), fu\u00dft hingegen auf diskreten einzelnen Merkmalenund Merkmalskombinationen und erlaubt somit eindeutige, widerspruchsfreieZuordnungen (Identifikationen).In Hannover optimieren wir dieses Verfahren und entwickeln es f\u00fcr halbautomatischeHochdurchsatzanalysen weiter. Grundlage hierf\u00fcr bilden alle Wirte, Erregerund Vektoren, die im Zoonosen-Zentrum der Tier\u00e4rztlichen Hochschule Hannoverbearbeitet werden. F\u00fcr unsere eigene Forschung konzentrieren wir uns auf dieInsekten, die erfolgreichste und artenreichste Tiergruppe der Erde (jede vierteTierart ist ein Insekt). Eine Teilgruppe hieraus, die gefl\u00fcgelten Insekten (Pterygota),stellen die \u00fcberragende Mehrzahl aller Zoonosen relevanter tierischer Vektoren.

Schl\u00fcsselw\u00f6rter:<\/span>
Zoonose, CAOS-barcoding, Pterygota, Insekten<\/p>","categories":["Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel"],"fromDate":"Nov 10, 2009 12:00:00 AM","toDate":"Dec 31, 2050 12:00:00 AM","oldUrls":["http:\/\/vetline.de\/zoonosis-caos-barcoding-pterygota-insects\/150\/3130\/69758"],"doiLanguage":"englisch","doiProductFormat":"Online","doiPublisher":"Schl\u00fctersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG","doiSerialWorkTitle":"Berl. M\u00fcnch. Tier\u00e4rztl. Wschr.","doiDocumentUri":"http:\/\/www.vetline.de\/zoonosis-caos-barcoding-pterygota-insects\/150\/3130\/69758","doiSource":"Berl. M\u00fcnch. Tier\u00e4rztl. Wschr. 122: 11-12, 446-450 (2009)","doiissn":"0005-9366","doiNr":"10.2376\/0005-9366-122-446","doiFirstPage":"446","doiLastPage":"450","doiTransmitted":true,"doiAuthor":"Bergmann T, Hadrys H, Breves G, Schierwater B","pdf":{"path":"http:\/\/data\/bmtw_2009_11_0446.pdf","title":"bmtw_2009_11_0446.pdf","description":"Character-based DNA barcoding: a superior tool for species classification

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Summary<\/strong>
In zoonosis research only correct assigned host-agent-vector associations canlead to success. If most biological species on Earth, from agent to host and fromprocaryotes to vertebrates, are still undetected, the development of a reliable anduniversal diversity detection tool becomes a conditio sine qua non. In this context,in breathtaking speed, modern molecular-genetic techniques have becomeacknowledged tools for the classification of life forms at all taxonomic levels.While previous DNA-barcoding techniques were criticised for several reasons(Moritz and Cicero, 2004; Rubinoff et al., 2006a, b; Rubinoff, 2006; Rubinoff andHaines, 2006) a new approach, the so called CAOS-barcoding (Character AttributeOrganisation System), avoids most of the weak points. Traditional DNA-barcodingapproaches are based on distances, i. e. they use genetic distances and treeconstruction algorithms for the classification of species or lineages. The definitionof limit values is enforced and prohibits a discrete or clear assignment. Incomparison, the new character-based barcoding (CAOS-barcoding; DeSalle et al.,2005; DeSalle, 2006; Rach et al., 2008) works with discrete single characters andcharacter combinations which permits a clear, unambiguous classification.In Hannover (Germany) we are optimising this system and developing a semiautomatichigh-throughput procedure for hosts, agents and vectors being studiedwithin the Zoonosis Centre of the \u201eStiftung Tier\u00e4rztliche Hochschule Hannover\u201c.Our primary research is concentrated on insects, the most successful and speciesrichanimal group on Earth (every fourth animal is a bug). One subgroup, thewinged insects (Pterygota), represents the outstanding majority of all zoonosisrelevant animal vectors.

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zoonosis, CAOS-barcoding, Pterygota, insects


Zusammenfassung<\/strong>
In der Zoonosenforschung gilt, \u201enur eine korrekt bestimmte Wirt-Erreger-VektorenGemeinschaft erlaubt korrekte Forschung\u201c. Wenn auf allen Ebenen, vom Vektorzum Wirt und vom Prokaryont bis Wirbeltier, die Mehrzahl der Arten, und damitder \u00f6kologisch relevanten Lebensformen, noch gar nicht beschrieben underkannt ist, wird die Entwicklung von zuverl\u00e4ssigen und universell anwendbarenDiversit\u00e4tsdetektoren zur conditio sine qua non. In diesem Kontext, wurden innahezu atemberaubenden Tempo moderne molekulargenetische Arbeitstechnikenanerkannte Hilfsmittel f\u00fcr die Bestimmung von Lebensformen auf allentaxonomischen Ebenen.

W\u00e4hrend bisherige DNA-Barcoding-Techniken aus verschiedenen Gr\u00fcnden indie Kritik gerieten (Moritz and Cicero, 2004; Rubinoff et al., 2006a, b; Rubinoff,2006; Rubinoff and Haines, 2006), umgeht eine neue Technik, das so genannteCAOS-Barcoding die Mehrzahl der bisherigen Schwachpunkte. Alle traditionellenDNA-Barcoding-Verfahren sind distanz-basiert, d. h. sie bedienen sich genetischerDistanzen und Baumbildungsverfahren zur Zuordnung und Identifikation vonArten oder Linien. Damit ist das Festlegen von \u201eGrenzwerten\u201c erzwungen, unddiskrete und eindeutige Zuordnungen sind nicht m\u00f6glich. Das neue, so genanntecharakterbasierende Barcoding-Verfahren (CAOS-Barcoding; DeSalle et al., 2005;DeSalle, 2006; Rach et al., 2008), fu\u00dft hingegen auf diskreten einzelnen Merkmalenund Merkmalskombinationen und erlaubt somit eindeutige, widerspruchsfreieZuordnungen (Identifikationen).In Hannover optimieren wir dieses Verfahren und entwickeln es f\u00fcr halbautomatischeHochdurchsatzanalysen weiter. Grundlage hierf\u00fcr bilden alle Wirte, Erregerund Vektoren, die im Zoonosen-Zentrum der Tier\u00e4rztlichen Hochschule Hannoverbearbeitet werden. F\u00fcr unsere eigene Forschung konzentrieren wir uns auf dieInsekten, die erfolgreichste und artenreichste Tiergruppe der Erde (jede vierteTierart ist ein Insekt). Eine Teilgruppe hieraus, die gefl\u00fcgelten Insekten (Pterygota),stellen die \u00fcberragende Mehrzahl aller Zoonosen relevanter tierischer Vektoren.

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W\u00e4hrend bisherige DNA-Barcoding-Techniken aus verschiedenen Gr\u00fcnden indie Kritik gerieten (Moritz and Cicero, 2004; Rubinoff et al., 2006a, b; Rubinoff,2006; Rubinoff and Haines, 2006), umgeht eine neue Technik, das so genannteCAOS-Barcoding die Mehrzahl der bisherigen Schwachpunkte. Alle traditionellenDNA-Barcoding-Verfahren sind distanz-basiert, d. h. sie bedienen sich genetischerDistanzen und Baumbildungsverfahren zur Zuordnung und Identifikation vonArten oder Linien. Damit ist das Festlegen von \u201eGrenzwerten\u201c erzwungen, unddiskrete und eindeutige Zuordnungen sind nicht m\u00f6glich. Das neue, so genanntecharakterbasierende Barcoding-Verfahren (CAOS-Barcoding; DeSalle et al., 2005;DeSalle, 2006; Rach et al., 2008), fu\u00dft hingegen auf diskreten einzelnen Merkmalenund Merkmalskombinationen und erlaubt somit eindeutige, widerspruchsfreieZuordnungen (Identifikationen).In Hannover optimieren wir dieses Verfahren und entwickeln es f\u00fcr halbautomatischeHochdurchsatzanalysen weiter. Grundlage hierf\u00fcr bilden alle Wirte, Erregerund Vektoren, die im Zoonosen-Zentrum der Tier\u00e4rztlichen Hochschule Hannoverbearbeitet werden. F\u00fcr unsere eigene Forschung konzentrieren wir uns auf dieInsekten, die erfolgreichste und artenreichste Tiergruppe der Erde (jede vierteTierart ist ein Insekt). Eine Teilgruppe hieraus, die gefl\u00fcgelten Insekten (Pterygota),stellen die \u00fcberragende Mehrzahl aller Zoonosen relevanter tierischer Vektoren.","schluesselwoerter":["Zoonose","CAOS-barcoding","Pterygota","Insekten"],"translatedTitle":"","abstractE":"In zoonosis research only correct assigned host-agent-vector associations canlead to success. If most biological species on Earth, from agent to host and fromprocaryotes to vertebrates, are still undetected, the development of a reliable ...","date":{"year":2009,"date":"11\/2009","accepted":"2009-11-10"},"volume":"122","openAccess":false,"journal":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","titleImageId":944,"pages":"446-450","redirects":["zoonosis-caos-barcoding-pterygota-insects\/150\/3130\/69758"],"tierartCategories":[],"artikelartCategories":["Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel"]} %8 11/2009