%0 Journal Article %K ORF5 %K cluster %K phylogenetic analysis %K molecular epidemiology %B Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift %C Hannover %D 2017 %G English %I Schlütersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG %R 10.2376/0005-9366-16036 %T Molecular epidemiology as an effective tool for the diagnosis and control of PRRSV infections in pig farms, illustrated using five cases %V 130 %1 {"oldId":100350,"title":"Molecular epidemiology as an effective tool for the diagnosis and control of PRRSV infections in pig farms, illustrated using five cases","topline":"","teaserText":"Molekulare Epidemiologie als wirksames Instrument zur Diagnostik und Kontrolle von PRRSV Infektionen in Schweinebest\u00e4nden, dargestellt anhand von f\u00fcnf Fallbeispielen","content":"

Summary<\/span>
The porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) has had a great economic impact on pig production in Germany. Repeated outbreaks with severe clinical cases and great economic losses in affected farms are reported. Due to the particularly high mutation rate of the PRRSV, molecular epidemiology plays an essential role in the diagnosis of PRRSV. In this study, 279 PRRSV isolates were initially detected by quantitative reverse transcription PCR, sequenced and then compared within each genotype. Of the isolates investigated, 234 belonged to genotype I and 45 to genotype II. On the basis of a cut-off value of 97% for assessment of homology, 110 genotype I clusters and seven genotype II clusters could be generated. Data from analyses on homology between isolates combined with supportive epidemiological data provided by a questionnaire allowed sources of PRRSV infections in pig farms to be traced. With help of 5 case studies, possible ways of PRRSV transmission into farms are described. There was a high probability that these farms were affected by pathogen transmission by air, semen or transportation vehicles. Pathogen transmission by new gilts could mostly be ruled out in one case and a possible virus circulation within a farm over a period of several years could be shown in another case.<\/p>

Keywords<\/span>
ORF5, cluster, phylogenetic analysis, molecular epidemiology<\/p>

Zusammenfassung<\/span>
Das Virus des porzinen reproduktiven und respiratorischen Syndroms (PRRSV) hat in Deutschland eine gro\u00dfe wirtschaftliche Bedeutung in der Schweineproduktion. Immer wieder kommt es zu Ausbr\u00fcchen mit schweren klinischen Verl\u00e4ufen und somit zu gro\u00dfen finanziellen Verlusten f\u00fcr die betroffenen Betriebe. Auf Grund der besonders hohen Mutationsrate des Virus spielt die molekulare Epidemiologie eine essenzielle Rolle bei der Diagnostik von PRRSV. Im Rahmen dieser Studie wurden 279 PRRSV-Isolate, in denen zun\u00e4chst mittels einer quantitativen Reversen Transkriptase PCR PRRS-Viren nachgewiesen wurden, sequenziert und innerhalb des jeweiligen Virustyps miteinander verglichen. Von den sequenzierten Isolaten geh\u00f6rten 234 Isolate dem Genotyp I und 45 Isolate dem Genotyp II an. Bei einem Cut-Off von 97% \u00dcbereinstimmung als Voraussetzung f\u00fcr die Clusterbildung ergaben sich beim Genotyp I 110 Cluster und beim Genotyp II sieben Cluster. Durch die zus\u00e4tzliche Erhebung eines epidemiologischen Fragebogens sowie die Analyse der Homologieverh\u00e4ltnisse der einzelnen Isolate zueinander konnten R\u00fcckschl\u00fcsse auf die Eintragsquelle der einzelnen PRRSV-Isolate in die einzelnen Betriebe gezogen werden. Anhand von 5 Fallbeispielen konnten diese m\u00f6glichen unterschiedlichen Eintragsm\u00f6glichkeiten von PRRSV in die Betriebe dargestellt werden. So wurde das Virus wahrscheinlich \u00fcber Luft, Sperma oder Transportfahrzeuge in die jeweiligen Betriebe eingetragen. Des Weiteren konnte ein Erregereintrag \u00fcber zugekaufte Jungsauen als unwahrscheinlich eingestuft und eine m\u00f6gliche Viruszirkulation in einem Betrieb \u00fcber mehrere Jahre dargestellt werden.<\/p>

Schl\u00fcsselw\u00f6rter<\/span>
ORF5, Cluster, Phylogenetische Analyse, Molekulare Epidemiologie<\/p>","categories":["Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel"],"fromDate":"Jan 31, 2017 11:00:00 PM","oldUrls":["http:\/\/vetline.de\/molecular-epidemiology-as-an-effective-tool-for-the-diagnosis-and-control-of-prrsv-infections-in-pig-farms-illustrated-using-five-cases\/150\/3130\/100350"],"doiLanguage":"englisch","doiProductFormat":"online","doiPublisher":"Schl\u00fctersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG","doiSerialWorkTitle":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","doiDocumentUri":"http:\/\/www.vetline.de\/molecular-epidemiology-as-an-effective-tool-for-the-diagnosis-and-control-of-prrsv-infections-in-pig-farms-illustrated-using-five-cases\/150\/3130\/100350\/","doiSource":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift 2017","doiissn":"0005-9366","doiNr":"10.2376\/0005-9366-16036","doiFirstPage":".","doiLastPage":"..","doiTransmitted":true,"doiAuthor":"Frey T, Richter A, Skrypski J, Sch\u00e4rfe C, Hoferer M","pdf":{"path":"http:\/\/data\/BUM_AOP_16036.pdf","title":"BUM_AOP_16036.pdf","description":"Molecular epidemiology as an effective tool for the diagnosis and control of PRRSV infections in pig farms, illustrated using five cases"},"authors":[{"firstName":"T","middleName":"","lastName":"Frey"},{"firstName":"A","middleName":"","lastName":"Richter"},{"firstName":"J","middleName":"","lastName":"Skrypski"},{"firstName":"C","middleName":"","lastName":"Sch\u00e4rfe"},{"firstName":"M","middleName":"","lastName":"Hoferer"}],"contentOptimised":"

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The porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) has had a great economic impact on pig production in Germany. Repeated outbreaks with severe clinical cases and great economic losses in affected farms are reported. Due to the particularly high mutation rate of the PRRSV, molecular epidemiology plays an essential role in the diagnosis of PRRSV. In this study, 279 PRRSV isolates were initially detected by quantitative reverse transcription PCR, sequenced and then compared within each genotype. Of the isolates investigated, 234 belonged to genotype I and 45 to genotype II. On the basis of a cut-off value of 97% for assessment of homology, 110 genotype I clusters and seven genotype II clusters could be generated. Data from analyses on homology between isolates combined with supportive epidemiological data provided by a questionnaire allowed sources of PRRSV infections in pig farms to be traced. With help of 5 case studies, possible ways of PRRSV transmission into farms are described. There was a high probability that these farms were affected by pathogen transmission by air, semen or transportation vehicles. Pathogen transmission by new gilts could mostly be ruled out in one case and a possible virus circulation within a farm over a period of several years could be shown in another case.<\/p>

Keywords:<\/strong>
ORF5, cluster, phylogenetic analysis, molecular epidemiology<\/p>

Zusammenfassung<\/strong>
Das Virus des porzinen reproduktiven und respiratorischen Syndroms (PRRSV) hat in Deutschland eine gro\u00dfe wirtschaftliche Bedeutung in der Schweineproduktion. Immer wieder kommt es zu Ausbr\u00fcchen mit schweren klinischen Verl\u00e4ufen und somit zu gro\u00dfen finanziellen Verlusten f\u00fcr die betroffenen Betriebe. Auf Grund der besonders hohen Mutationsrate des Virus spielt die molekulare Epidemiologie eine essenzielle Rolle bei der Diagnostik von PRRSV. Im Rahmen dieser Studie wurden 279 PRRSV-Isolate, in denen zun\u00e4chst mittels einer quantitativen Reversen Transkriptase PCR PRRS-Viren nachgewiesen wurden, sequenziert und innerhalb des jeweiligen Virustyps miteinander verglichen. Von den sequenzierten Isolaten geh\u00f6rten 234 Isolate dem Genotyp I und 45 Isolate dem Genotyp II an. Bei einem Cut-Off von 97% \u00dcbereinstimmung als Voraussetzung f\u00fcr die Clusterbildung ergaben sich beim Genotyp I 110 Cluster und beim Genotyp II sieben Cluster. Durch die zus\u00e4tzliche Erhebung eines epidemiologischen Fragebogens sowie die Analyse der Homologieverh\u00e4ltnisse der einzelnen Isolate zueinander konnten R\u00fcckschl\u00fcsse auf die Eintragsquelle der einzelnen PRRSV-Isolate in die einzelnen Betriebe gezogen werden. Anhand von 5 Fallbeispielen konnten diese m\u00f6glichen unterschiedlichen Eintragsm\u00f6glichkeiten von PRRSV in die Betriebe dargestellt werden. So wurde das Virus wahrscheinlich \u00fcber Luft, Sperma oder Transportfahrzeuge in die jeweiligen Betriebe eingetragen. Des Weiteren konnte ein Erregereintrag \u00fcber zugekaufte Jungsauen als unwahrscheinlich eingestuft und eine m\u00f6gliche Viruszirkulation in einem Betrieb \u00fcber mehrere Jahre dargestellt werden.<\/p>

Schl\u00fcsselw\u00f6rter:<\/strong>
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