TY - JOUR KW - fermentation residues KW - enterococci KW - Enterobacteriaceae KW - clostridia KW - ESBL AU - S Speck AU - J Pospiech AU - U Truyen AB - Fermentation products of biogas plants can be used as a fertilizer on farm land but may contain zoonotic pathogens. In Germany, no statutory requirements regarding sampling, test methods and test procedure for bacteriological analyses of biogas plant residues are available. We compared the suitability of differential selective and chromogenic media for the detection of Escherichia coli, coliform bacteria, Salmonella, enterococci, and Clostridium perfringens in artificially spiked matrices and fermentation residues from biogas plants. The limit of detection determined for a particular culture medium using spiked matrix was dependent on the bacterial strain used. 0 samples from biogas plants were used to evaluate the practicability of in vitro assessed media. The background microflora associated with these samples considerably influenced the performance of the media. Overall, we encountered difficulties with most of the agar tested including colour interpretation and colony colour of bacteria on chromogenic media other than the given specifications of the manufacturer. The results obtained in this study show that knowing about the limitations of culture techniques and media is of paramount importance when recommending test procedures for a particular purpose. BT - Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift C1 - {"oldId":97763,"title":"Comparison of different culture media for the detection of selected target bacteria in samples from biogas plants","topline":"","teaserText":"Vergleich verschiedener N\u00e4hrmedien f\u00fcr den Nachweis von ausgew\u00e4hlten Indikator-Bakterien in Proben von Biogasanlagen","content":"

Summary<\/span>
Fermentation products of biogas plants can be used as a fertilizer on farm land but may contain zoonotic pathogens. In Germany, no statutory requirements regarding sampling, test methods and test procedure for bacteriological analyses of biogas plant residues are available. We compared the suitability of differential selective and chromogenic media for the detection of Escherichia coli, coliform bacteria, Salmonella, enterococci, and Clostridium perfringens in artificially spiked matrices and fermentation residues from biogas plants. The limit of detection determined for a particular culture medium using spiked matrix was dependent on the bacterial strain used. \ufeff0 samples from biogas plants were used to evaluate the practicability of in vitro assessed media. The background microflora associated with these samples considerably influenced the performance of the media. Overall, we encountered difficulties with most of the agar tested including colour interpretation and colony colour of bacteria on chromogenic media other than the given specifications of the manufacturer. The results obtained in this study show that knowing about the limitations of culture techniques and media is of paramount importance when recommending test procedures for a particular purpose.<\/p>

Keywords<\/span>
fermentation residues, enterococci, Enterobacteriaceae, clostridia, ESBL<\/p>

Zusammenfassung<\/span>
Im Rahmen der Biogasproduktion fallen G\u00e4rreste an, die als Wirtschaftsd\u00fcnger in der Landwirtschaft eingesetzt werden k\u00f6nnen. Eine Belastung dieser G\u00e4rreste mit Zoonoseerregern ist nicht auszuschlie\u00dfen. F\u00fcr die bakteriologische Untersuchung von G\u00e4rresten, einschlie\u00dflich Probenentnahmeplan und anzuwendende Testmethode gibt es in Deutschland keine gesetzlichen Vorgaben. Im Rahmen einer Studie wurde die Eignung von verschiedenen selektiven und chromogenen N\u00e4hrmedien f\u00fcr den Nachweis von Escherichia coli, coliformen Bakterien, Salmonellen, Enterokokken und Clostridium perfringens untersucht. Hierf\u00fcr wurden Matrices im Labor mit definierten Keimzahlen infiziert und die Nachweisgrenze f\u00fcr jedes Medium bestimmt. Es zeigte sich, dass die ermittelte Nachweisgrenze vom verwendeten Bakterienstamm abh\u00e4ngig war. \ufeff0 Proben aus Biogasanlagen wurden untersucht, um die Anwendbarkeit der im Labor ausgetesteten Medien in der Praxis zu beurteilen. Mit fast allen N\u00e4hrmedien ergaben sich Schwierigkeiten, die die Interpretation der Farbe auf den chromogenen N\u00e4hrmedien betrafen sowie das Wachstum von Bakterien, die nicht der Vorgabe des Herstellers entsprachen. Die Ergebnisse dieser Studie verdeutlichen, dass das Kennen und Erkennen der Grenzen eines Untersuchungsverfahrens und der angewendeten N\u00e4hrmedien unerl\u00e4sslich ist, vor allem dann, wenn Empfehlungen f\u00fcr eine spezifische Anwendung herausgegeben werden sollen.<\/p>

Schl\u00fcsselw\u00f6rter<\/span>
G\u00e4rreste, Enterokokken, Enterobacteriaceae, Clostridien, ESBL<\/p>","categories":["Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel"],"fromDate":"Sep 11, 2016 10:00:00 PM","oldUrls":["http:\/\/vetline.de\/comparison-of-different-culture-media-for-the-detection-of-selected-target-bacteria-in-samples-from-biogas-plants\/150\/3130\/97763"],"doiLanguage":"englisch","doiProductFormat":"online","doiPublisher":"Schl\u00fctersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG","doiSerialWorkTitle":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","doiDocumentUri":"http:\/\/www.vetline.de\/comparison-of-different-culture-media-for-the-detection-of-selected-target-bacteria-in-samples-from-biogas-plants\/150\/3130\/97763\/","doiSource":"Berl M\u00fcnch Tier\u00e4rztl Wochenschr 129, 382\u2013388 (2016) ","doiissn":"0005-9366","doiNr":"10.2376\/0005-9366-15081","doiFirstPage":"382","doiLastPage":"388","doiTransmitted":true,"doiAuthor":"Speck S, Pospiech J, Truyen U","pdf":{"path":"http:\/\/data\/BMW_2016_09_10_0382.pdf","title":"BMW_2016_09_10_0382.pdf","description":"Comparison of different culture media for the detection of selected target bacteria in samples from biogas plants"},"authors":[{"firstName":"S","middleName":"","lastName":"Speck"},{"firstName":"J","middleName":"","lastName":"Pospiech"},{"firstName":"U","middleName":"","lastName":"Truyen"}],"contentOptimised":"

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Fermentation products of biogas plants can be used as a fertilizer on farm land but may contain zoonotic pathogens. In Germany, no statutory requirements regarding sampling, test methods and test procedure for bacteriological analyses of biogas plant residues are available. We compared the suitability of differential selective and chromogenic media for the detection of Escherichia coli, coliform bacteria, Salmonella, enterococci, and Clostridium perfringens in artificially spiked matrices and fermentation residues from biogas plants. The limit of detection determined for a particular culture medium using spiked matrix was dependent on the bacterial strain used. \ufeff0 samples from biogas plants were used to evaluate the practicability of in vitro assessed media. The background microflora associated with these samples considerably influenced the performance of the media. Overall, we encountered difficulties with most of the agar tested including colour interpretation and colony colour of bacteria on chromogenic media other than the given specifications of the manufacturer. The results obtained in this study show that knowing about the limitations of culture techniques and media is of paramount importance when recommending test procedures for a particular purpose.<\/p>

Keywords:<\/strong>
fermentation residues, enterococci, Enterobacteriaceae, clostridia, ESBL<\/p>

Zusammenfassung<\/strong>
Im Rahmen der Biogasproduktion fallen G\u00e4rreste an, die als Wirtschaftsd\u00fcnger in der Landwirtschaft eingesetzt werden k\u00f6nnen. Eine Belastung dieser G\u00e4rreste mit Zoonoseerregern ist nicht auszuschlie\u00dfen. F\u00fcr die bakteriologische Untersuchung von G\u00e4rresten, einschlie\u00dflich Probenentnahmeplan und anzuwendende Testmethode gibt es in Deutschland keine gesetzlichen Vorgaben. Im Rahmen einer Studie wurde die Eignung von verschiedenen selektiven und chromogenen N\u00e4hrmedien f\u00fcr den Nachweis von Escherichia coli, coliformen Bakterien, Salmonellen, Enterokokken und Clostridium perfringens untersucht. Hierf\u00fcr wurden Matrices im Labor mit definierten Keimzahlen infiziert und die Nachweisgrenze f\u00fcr jedes Medium bestimmt. Es zeigte sich, dass die ermittelte Nachweisgrenze vom verwendeten Bakterienstamm abh\u00e4ngig war. \ufeff0 Proben aus Biogasanlagen wurden untersucht, um die Anwendbarkeit der im Labor ausgetesteten Medien in der Praxis zu beurteilen. Mit fast allen N\u00e4hrmedien ergaben sich Schwierigkeiten, die die Interpretation der Farbe auf den chromogenen N\u00e4hrmedien betrafen sowie das Wachstum von Bakterien, die nicht der Vorgabe des Herstellers entsprachen. Die Ergebnisse dieser Studie verdeutlichen, dass das Kennen und Erkennen der Grenzen eines Untersuchungsverfahrens und der angewendeten N\u00e4hrmedien unerl\u00e4sslich ist, vor allem dann, wenn Empfehlungen f\u00fcr eine spezifische Anwendung herausgegeben werden sollen.<\/p>

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